تقع في "حصن بابليون"، وبُنيت في القرن السابع الميلادي في عهد "عبد العزيز بن مروان". بها مكان إقامة "العائلة المقدسة" وبئرًا استخدمته السيدة العذراء. تتميز بهيكل مزخرف وأيقونات ومخطوطات وأعمال خشبية نادرة. وتُعد من أهم الكنائس القبطية لأنها بُنيت في الموقع الذي تشرف بزيارة "العائلة المقدسة".