Elle est située dans la Forteresse de Babylone et fut construite au VIIe siècle de notre ère, sous le règne d'Abd al-Aziz ibn Marwan. Elle abrite le lieu de séjour de la Sainte Famille ainsi qu'un puits utilisé par la Vierge Marie. Elle se distingue par une iconostase ornée, des icônes, des manuscrits et des œuvres en bois rares. Elle est considérée comme l'une des églises coptes les plus importantes car elle fut édifiée sur le site honoré par la visite de la Sainte Famille.